Se trata de un error al quedar el JRE de Java en un estado inconsistente, habitualmente al instalar una versión del JDK obsoleta. Al parecer, el fichero jvm.cfg se encarga de contener configuración necesaria para ejecutar los comandos java y javac utilizados por las aplicaciones e IDEs como Eclipse y sus derivados, como es el caso de Anypoint Studio.
La única solución es reinstalar el JDK/JRE a su última versión. En nuestro caso hemos descargado la versión 1.8u111 de http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html para evitar el error. Una vez reparada la instalación del JDK las aplicaciones java, los IDEs y el compilador volverán a funcionar.
